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基于Super-BSA技术对汉麻纤维含量相关基因的挖掘
2021-06-17 11:29:10

项目名称:基于Super-BSA技术对汉麻纤维含量相关基因的挖掘

项目级别:省科学院院青年创新基金面上项目

起止时间:2019.01-2020.12

项目介绍:项目采用简化基因组深度测序技术(SLAF-seq)对样本进行高通量测序,开发出了368,404个SLAF标签。挖掘出了6个汉麻纤维含量相关基因,为高纤维含量汉麻遗传改良提供了理论基础和基因材料。

1 SLAF标签(黑色线)在汉麻染色体上的分布

Fig1. The distribution diagrams of all SLAFs (black lines)on Cannabis sativa genome





2 SNP-index关联值在染色体上的分布

Fig2. Distribution of SNP-index correlation values on chromosomes注:横坐标为染色体名称,彩色的点代表计算出来的SNP-index(或ΔSNP-index)值,黑色的线为拟合后的SNP-index(或ΔSNP-index)值。上图是隐性混池的SNP-index值的分布图;中图是显性混池的SNP-index值的分布图;下图是ΔSNP-index值的分布图,其中红色的线代表99百分位数的阈值线。